纳析科技高光时刻丨Multi-SIM助力客户成就Nature子刊

 

助力研究新发现

 

 

2024年5月,浙江大学医学院/良渚实验室钱鹏旭/黄河团队在《Nature Cell Biology》杂志上发表了题为《Phase separation-competent FBL promotes early pre-rRNA processing and translation in acute myeloid leukaemia》的研究论文。通过在小鼠体内进行CRISPR筛选,研究发现在AML(acute myeloid leukaemia)进程中,关键的RBPs(RNA-binding proteins)主要集中在核仁,并确定了FBL(Fibrillarin)作为一个关键核仁蛋白,在促进AML细胞生长、分化阻滞、存活以及维持白血病干/祖细胞(LSPC)自我更新能力方面发挥重要作用。

 

 

该研究描述了FBL在核仁结构和功能中的非典型角色,导致AML白血病发展过程中关键致癌基因的翻译活性增强。同时还展示了药理调控FBL的相分离属性作为一种潜在有效的抗白血病治疗方法。

 

核仁是什么?

 

 

在深入解析FBL之前需要先了解核仁是什么?核仁在细胞核内是单一的或者多个匀质的球形小体,呈中圆形或椭圆形的颗粒状结构,没有外膜。

 

核仁超微结构有纤维中心(FC)、致密纤维组分(DFC)、颗粒组分(GC)三个特征性的区域。

 

纤维中心(FC)

RECRUIT

被DFC包围的一个或几个低电子密度的圆形结构区域,主要成分为rDNA,可看成rRNA.基因储存的场所。

 

致密纤维组分(DFC)

RECRUIT

由致密的纤维构成,是核仁中电子密度最高的部分,是新合成的rRNA.及其结合蛋白存在的场所,rRNA.剪切和加工场所,是FBL表达后的主要分布区。

 

颗粒组分(GC)

RECRUIT

由核糖核蛋白颗粒构成,是正在加工成熟的核糖体亚单位的前体颗粒,容易被蛋白酶和RNase(核糖核酸酶)水解,可以使用NPM1实现特异性标记。

 

Multi-SIM提供超分辨采集超微结构细胞

 

 

Multi-SIM在该文章里的贡献:

采集到核仁的超微结构,如下图展示的是EGFP标记的FBL及其不同突变体在AML细胞中的定位及形态(i是共聚焦结果,j图是Multi-SIM结果),Multi-SIM以其分辨率高的特点把核仁中的GC与DFC区显著的区分开。

 

图注:j左侧原理图中FC表示纤维中心、DFC表示核仁中的致密纤维组分,GC表示颗粒组分。紫色标记的是NPM1(核仁的GC区)、绿色标记的是FBL及其不同突变体(核仁DFC区)。

 

通过对Multi-SIM的采集结果分析后得出结论:

GAR缺陷突变体(MD、H2B-MD和PLD-MD)产生较小的点状物,未能与原纤维中心蛋白完全分离并形成不完整的空心结构。相反,RBD缺陷突变体(GAR和GAR-Helix)表现出更少和更大的缩合物分散在细胞核中,这些发现强调了GAR和RBD对FBL相分离驱动DFC区域形成的重要贡献,突出了 蛋白无序序列和RNA结合能力在FBL相分离行为中的关键作用。

 

图注:在野生型FBL或指定突变体的FBL敲低的HL-60细胞中,同时标记DFCs(标记为NOP58)和5′ETS附着的前rRNA的代表性SIM图像。

 

此图的成像结果表明:

转录后,pre-rRNA从原纤维中心内的转录区域迁移到DFC进行切割和修饰。RNA荧光原位杂交(RNA FISH)表明,只有FBL含有完整的GAR和MD区域才有相分离性质,才能将前rRNA的5′末端精确定位到DFC。

 

研究成果总结

 

 

总的来说,该工作通过超分辨显微成像技术、胞内外相分离凝聚体重构实验及RNA-FISH、RiboMeth-Seq、Northern blot、翻译组测序等实验得到的研究结果不仅增进了我们对核仁蛋白在AML发展中的作用的理解,还强调了开发针对FBL的相分离调节剂作为AML治疗方法的潜力。

 

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原文献链接

https://www.nature.com/articles/s41556-024-01420-z

 

 

 

2024-05-23